Rekrutacja specjalna do Wrocławskiej Szkoły Doktorskiej Instytutów Polskiej Akademii Nauk we Wrocławiu na doktoranta – stypendystę w programie „Doktorat wdrożeniowy I” MEiN

INSTYTUCJA: Instytut Immunologii i Terapii Doświadczalnej Polskiej Akademii Nauk im. Ludwika Hirszfelda
MIASTO: Wrocław
STANOWISKO: Doktorant - stypendysta w programie Ministerstwa Edukacji i Nauki (MEiN) “Doktorat wdrożeniowy I” 
DYSCYPLINA NAUKOWA: nauki biologiczne
DATA OGŁOSZENIA: 11.08.2022 
TERMIN SKŁADANIA DOKUMENTÓW: 14.09.2022
DATA ROZSTRZYGNIĘCIA KONKURSU: 20.09.2022
OKRES I  DATA ROZPOCZĘCIA KSZTAŁCENIA: 4 lata, od 01.10.2022 
LINK DO STRONY WSD IPAN: http://wsdipan.intibs.pl 
LINK DO STRONY IITD PAN: https://hirszfeld.pl/
SŁOWA KLUCZOWE: Algorytm diagnostyczny, rak jelita grubego, dziedziczna predyspozycja do nowotworów, geny MMR, sekwencjonowanie następnej generacji, MS-MLPA, ilościowy PCR


OGŁOSZENIE O KONKURSIE

Wrocławska Szkoła Doktorska Instytutów Polskiej Akademii Nauk (WSD IPAN) ogłasza rekrutację specjalną na doktoranta - stypendystę w VI edycji programu „Doktorat wdrożeniowy I” - temat: „Opracowanie molekularnego algorytmu diagnostycznego u pacjentów z nowotworem jelita grubego – kompleksowe badanie dziedzicznej predyspozycji do HNPCC w odniesieniu do charakterystyki molekularnej tkanki nowotworowej i danych klinicznych”, realizowanego na zlecenie Ministerstwa Edukacji i Nauki (DWD/6/0426/2022) pod kierunkiem dr hab. Małgorzaty Cebrat w Laboratorium Immunologii Molekularnej i Komórkowej Instytutu Immunologii i Terapii Doświadczalnej Polskiej Akademii Nauk we współpracy z Dolnośląskim Centrum Onkologii, Pulmonologii i Hematologii.


 1. Opis tematu: 

Zespół Lyncha rozpoznaje się u około 3–4% pacjentów z rakiem jelita grubego. Średni wiek zachorowania u nosicieli wariantów patogennych w genach krytycznych dla HNPCC to około 44 lata (w przypadkach sporadycznych 60-70 lat), a ryzyko zachorowania rośnie wraz z wiekiem: u mężczyzn wynosi 80%, a u kobiet 40%. W spektrum HNPCC diagnozuje się także nowotwory takie jak: endometrium i jajnika u kobiet, jelita cienkiego, żołądka, układu moczowego, pęcherzyka i przewodów żółciowych, trzustki, OUN.
Podłoże genetyczne HNPCC stanowi obecność germinalnych wariantów patogennych w genach naprawy źle sparowanych zasad  (MMR , DNA mismatch repair genes): MLH1, MSH2, MSH6 i PMS2, oraz w genie EPCAM, które wykazują efekt autosomalny dominujący. Prowadzi to do zaburzenia naprawy DNA, akumulacji mutacji w komórce i powstania tzw. fenotypu mutatorowego z niestabilnością mikrosatelitarną.
Immunohistochemiczne testy MMR IHC (wykrywanie braku ekspresji białek kodowanych przez geny MMR) wykonywane w guzach jelita grubego pozwalają na identyfikację potencjalnych nosicieli mutacji germinalnych genów MMR, przy czym należy wykluczyć z tej grupy pacjentów, w których tkance wykazano niestabilność mikrosatelitarną oraz utratę ekspresji genu MLH1 z powodu hipermetylacji jego promotora i/lub z mutację genu BRAF V600  (charakterystyczne dla 15–20% sporadycznych raków jelita grubego).
Obecnie w DCOPiH stopniowo wdrażana jest kompleksowa diagnostyka i opieka nad chorymi z podejrzeniem HNPCC. Celem projektu jest nawiązanie ścisłej współpracy między oddziałem klinicznym, laboratorium molekularnym oraz Poradnią Genetyczną oraz wprowadzenie algorytmu diagnostycznego i maksymalne skrócenie czasu badania o obniżonych kosztach.


2. Dodatkowe informacje 

Doktorat realizowany jest na podstawie Komunikatu Ministra Edukacji i Nauki z dnia 29 kwietnia 2022 r. o ustanowieniu VI edycji programu „Doktorat wdrożeniowy” i naborze wniosków, zwanego dalej Komunikatem MEiN, który określa, że miesięczna kwota stypendium doktoranckiego, o którym mowa w art. 209 ust. 1 ustawy z dnia 20 lipca 2018 r. – Prawo o szkolnictwie wyższym i nauce (Dz. U. z 2018 r. poz. 1668 z późn. zm.), zwanej dalej Ustawą, wynosi:

1.      3450 zł (brutto) – do miesiąca, w którym została przeprowadzona ocena śródokresowa (planowo do końca II roku akad.);

2.      4450 zł (brutto) – po miesiącu, w którym została przeprowadzona ocena śródokresowa (planowo w III i IV roku akad.).

Rekrutacja prowadzona jest zgodnie z wymogami zawartymi w Ustawie, Komunikacie MEiN oraz Zasadach Rekrutacji do Wrocławskiej Szkoły Doktorskiej Instytutów Polskiej Akademii Nauk.

3. Obowiązki doktoranta-stypendysty: 

- terminowa realizacja indywidualnego planu badawczego, spójnego z harmonogramem doktoratu wdrożeniowego,

- przygotowanie materiału do badania, analiza dostępnej literatury, wybór paneli diagnostycznych, zaprojektowanie panelu NGS, opracowanie metodologii badawczej, wykonanie badań, opracowanie uzyskanych danych       

- analiza i prezentacja wyników eksperymentalnych, przygotowanie raportów i publikacji naukowych, udział w konferencjach naukowych,

-  realizacja programu kształcenia i zadań wynikających z obowiązków doktoranta WSD IPAN.
-  przygotowanie i złożenie rozprawy doktorskiej najpóźniej po koniec 4. roku doktoratu i uzyskanie stopnia naukowego doktora  

 
4. Warunki jakie powinien spełniać Kandydat: 

- tytuł zawodowy magistra analityki medycznej i aktualne prawo wykonywania zawodu diagnosty laboratoryjny

- zainteresowania naukowe w obszarze genetyki człowieka

- wiedza i doświadczenie w pracy eksperymentalnej na materiale ludzkim w zakresie metod biologii molekularnej

- dobra znajomość języka angielskiego

 
5. Wymagane dokumenty: 

Określone w dokumencie Zasady rekrutacji do Wrocławskiej Szkoły Doktorskiej Instytutów Polskiej Akademii Nauk

https://www.intibs.pl/dla-studentow/zasady-rekrutacji.html

  • wypełniony formularz zintegrowany pobrany ze strony internetowej WSD IPAN zawierający: wniosek o przyjęcie do Szkoły, kwestionariusz osobowy oraz oświadczenie, że w przypadku przyjęcia do WSD IPAN będzie to jedyna szkoła doktorska, w której Kandydat będzie się kształcił;
  • życiorys zawierający listę publikacji naukowych, stypendiów i nagród, listę konferencji, w których brał udział Kandydat wraz z tytułami i autorami wystąpień;
  • list motywacyjny zawierający krótki opis zainteresowań i osiągnięć naukowych oraz uzasadnienia zamiaru podjęcia kształcenia w szkole doktorskiej;
  • odpis dyplomu potwierdzającego ukończenie studiów bądź zaświadczenie o uzyskaniu tytułu magistra, ewentualnie zaświadczenie o wyznaczonym terminie obrony;
  • odpis (kopię) całego indeksu studiów pierwszego i drugiego stopnia (lub jednolitych studiów magisterskich), albo suplement do dyplomu z ocenami z całych studiów, albo potwierdzone przez dziekanat karty ocen studenta ze wszystkich lat studiów;
  • certyfikat znajomości języka angielskiego na poziomie B2 lub wyższym (nie dotyczy kandydatów, którzy zdali egzamin kończący kurs na tym poziomie w toku studiów),

Dodatkowo obowiązkowy dokument:

Oświadczenie Dolnośląskiego Centrum Onkologii, Pulmonologii i Hematologii, że Kandydat przyjęty do Wrocławskiej Szkoły Doktorskiej Instytutów Polskiej Akademii Nauk w ramach programu „Doktorat wdrożeniowy” MEiN jest lub zostanie zatrudniony nie później niż od 1 października 2022 r., w pełnym wymiarze czasu pracy na czas realizacji doktoratu wdrożeniowego a także, że firma wyraża zgodę na jego udział w szkole doktorskiej w ramach programu i zapewni opiekuna pomocniczego spośród swoich pracowników.


6. Podania kandydatów o przyjęcie do Szkoły należy składać do dnia 14 września 2022 roku do godz. 15:00: 

- osobiście w Sekretariacie Szkoły w Instytucie Niskich Temperatur i Badań Strukturalnych PAN przy ul. Okólnej 2 we Wrocławiu) w godzinach od 9:00 do 15:00

albo
- przesyłką pocztową rejestrowaną lub kurierską (decyduje data wpływu dokumentów do siedziby Szkoły) na adres: WSD IPAN, ul. Okólna 2, 50-422 Wrocław

albo

- elektronicznie na adres (z dopiskiem WD_MC), przy czym oryginały dokumentów należy dostarczyć przed rozpoczęciem kształcenia (niedopełnienie tego wymogu będzie skutkowało skreśleniem z listy doktorantów).


Klauzula informacyjna

Na podstawie art. 13 rozporządzenia Parlamentu Europejskiego i Rady (UE) 2016/679 z dnia 27 kwietnia 2016 r. w sprawie ochrony osób fizycznych w związku z przetwarzaniem danych osobowych i w sprawie swobodnego przepływu takich danych oraz uchylenia dyrektywy 95/46/WE (ogólne rozporządzenie o ochronie danych) (Dz. Urz. UE L 119 z 04.05.2016, str. 1), dalej „RODO", informuję, że:

  • Administratorem Pani/Pana danych osobowych jest Instytut Immunologii i Terapii Doświadczalnej im. Ludwika Hirszfelda Polskiej Akademii Nauk we Wrocławiu, ul. Rudolfa Weigla 12, 53-114 Wrocław
  • Z administratorem danych osobowych można kontaktować się listownie na podany w pkt 1 powyżej adres, lub telefonicznie pod numerem telefonu 71 3709940, zaś z wyznaczonym przez niego inspektorem ochrony danych można się kontaktować we wszystkich sprawach dotyczących przetwarzania danych poprzez konto e-mail: lub listownie na adres siedziby.
  • Dane osobowe będą przetwarzane w celu realizacji zadań administratora związanych z przeprowadzeniem rekrutacji do projektu badawczego pt. „Opracowanie molekularnego algorytmu diagnostycznego u pacjentów z nowotworem jelita grubego – kompleksowe badanie dziedzicznej predyspozycji do HNPCC w odniesieniu do charakterystyki molekularnej tkanki nowotworowej i danych klinicznych”, realizowanego na zlecenie Ministerstwa Edukacji i Nauki (DWD/6/0426/2022) oraz do Wrocławskiej Szkoły Doktorskiej Instytutów Polskiej Akademii Nauk, tym samym Pani/Pana dane osobowe będą przetwarzane na podstawie ustawy z dnia 20 lipca 2018 r. Prawo o szkolnictwie wyższym i nauce (art. 6 ust. 1 lit. c RODO), prawnie uzasadnionego interesu Administratora związanego z realizacją projektu badawczego (art. 6 ust. 1 lit. f RODO)
  • Podanie przez Panią/Pana danych osobowych jest dobrowolne, ale niezbędne do realizacji wskazanych powyżej celów.
  • Dane osobowe zgromadzone w obecnym procesie rekrutacji będą przechowywane przez okres rekrutacji.
  • Osobie, której dane są przetwarzane przysługuje prawo do: dostępu do danych osobowych, żądania sprostowania danych osobowych, żądania usunięcia danych osobowych, żądania ograniczenia przetwarzania danych osobowych, wyrażenia sprzeciwu wobec przetwarzania danych ze względu na szczególną sytuację.
  • Osoba, której dane są przetwarzane ma również prawo wniesienia skargi do Prezesa Urzędu Ochrony Danych Osobowych, w wypadku uznania, że Administrator naruszył przepisy o ochronie danych osobowych.
  • Wskutek przetwarzania nie będą podejmowane decyzje w sposób zautomatyzowany (bez udziału człowieka), w tym również nie będą oparte o profilowanie.
  • Dane osobowe mogą być udostępniane naszym upoważnionym pracownikom, podmiotom przetwarzającym, tj. dokonującym czynności na nasze zlecenie (np. usługi informatyczne, księgowe), zaś dane osobowe wybranego w konkursie Kandydata mogą zostać następnie udostępnione podmiotom trzecim uprawnionym z mocy przepisów prawa.